Von Oktober 2020 bis Juli 2021 wurden in Kap Verde 21 SARS-CoV-2-Stämme nachgewiesen, zwei besorgniserregende Varianten und eine Variante von Interesse. Viele der entdeckten Stämme, die in Europa und den USA beheimatet sind, werden in Afrika nur unzureichend und manchmal überhaupt nicht gemeldet.
Die Daten wurden heute auf einem Workshop zur Vorstellung der Ergebnisse der Genomsequenzierung des SARS-CoV-2-Virus auf den Kapverden durch den Sequenzierungsbeauftragten Kevin Sanders vorgestellt.
Laut Sanders werden zwischen Oktober 2020 und Juli 2021 insgesamt 215 Proben von sieben kapverdischen Inseln in Dakar sequenziert. Von der Insel Santiago wurden 155 Proben genommen, von São Vicente 23, Sal 10, Fogo 14, Boa Vista fünf, Brava vier und Santo Antão vier.
Die Proben wurden in fünf verschiedenen Zeiträumen verschickt. Im ersten Zeitraum, von Oktober 2020 bis Februar 2021, wurden 44 Proben sequenziert.
In diesem Zeitraum wurden 12 Abstammungslinien entdeckt, wobei die Häufigkeit der Abstammungslinie B.1 höher war. Ebenfalls in diesem Zeitraum wurde die erste bedenkliche Variante, Alpha, in vier Proben von der Insel Santiago nachgewiesen.
“Wir haben auch einen interessanten Fund des M.2-Stammes gemacht, der bisher nur auf den Kapverden auf afrikanischer Ebene nachgewiesen wurde”, so Kevin Sanders.
Im zweiten Zeitraum, von Februar bis April dieses Jahres, wurden 51 Proben sequenziert, und die B.1-Linie ist nach wie vor die häufigste. Bei der Alpha-Variante gab es jedoch einen Anstieg von 4 auf 16.
Neun Abstammungslinien wurden entdeckt, und die Proben der Alpha-Variante stammten in diesem Zeitraum von den Inseln Santiago und Sal.
Im dritten Zeitraum, d. h. im März und April 2021, war ein deutlicher Anstieg der Alpha-Variante zu verzeichnen, was laut Kevin Sanders erklärt, warum die Positivitätsrate und die Sterblichkeitsrate in diesem Zeitraum zunahmen.
Damals wurden auch Stämme identifiziert, und die Alpha-Variante wurde auf den Inseln Santiago, Sal, Santo Antão und São Vicente nachgewiesen. Acht Proben von Verstorbenen wurden ebenfalls sequenziert, und von diesen acht waren sieben von der Alpha-Variante.
Im vierten Zeitraum wurden 51 Proben aus dem Monat Mai 2021 eingesandt, und nur zwei Stämme, B.1 und Alpha, wurden nachgewiesen.
“Hier gab es einen Rückgang bei der Alpha-Variante, und in diesem Monat hatten wir auch einen Rückgang der Positivitäts- und Mortalitätsrate. Die Alpha-Variante wurde auf den Inseln Santiago und Fogo entdeckt”, erklärte er.
Schließlich wurden 16 Proben aus den Monaten Juni und Juli 2021 sequenziert und drei Abstammungslinien identifiziert.
In diesem Zeitraum wurde die zweite bedenkliche Variante, Delta, in vier Proben von der Insel Santiago nachgewiesen.
Von diesen vier Proben stammen drei aus Portugal. Außerdem wurde die erste Variante von Interesse, Eta, in einer Probe ebenfalls aus Santiago identifiziert.
“Kurz gesagt, wir haben 21 Stämme im ganzen Land entdeckt. Alpha und B.1 sind mit 70 Proben am häufigsten vertreten. L.2 wurde nur auf den Kapverden, auf der Insel São Vicente und Delta nur in Santiago sowie auf Eta entdeckt”, so Sanders.
Die Insel Santiago wies laut Sanders die meisten Stämme auf, gefolgt von der Insel Sao Vicente, Santo Antão und Fogo, Sal, Brava und Boa Vista.
Während die Variante als genetische Veränderung des Virus während seines Replikationsprozesses verstanden wird, ist die Abstammungslinie eine Reihe von Varianten, die von einem gemeinsamen Vorläufervirus abstammen.
Die WHO unterteilt die Varianten von COVID-19 in bedenkliche und interessante Varianten. Bedenklich sind die Varianten mit der höchsten Übertragungsrate und dem größten Potenzial, schwere Infektionen zu verursachen. Zu dieser Kategorie gehören die Varianten Delta, Alpha, Beta und Gamma.
Andererseits sind Varianten von Interesse, die ebenfalls identifiziert wurden, aber offenbar noch nicht so leicht übertragbar oder so schwerwiegend sind wie die bedenklichen Varianten.
Zu dieser Kategorie gehören die Varianten Epsilon, Zeta, Eta, Theta, Iota, Capa und Lambda.
